21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0344 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  766    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  45.31 
 
 		 372 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  45.26 
 
 		 374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1471  ATPase-like protein  32.24 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.77 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.81 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.46 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  33.93 
 
 		 666 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.63 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  52.27 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  28.81 
 
 		 530 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.74 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.5 
 
 		 647 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  28.85 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  24.01 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  24.3 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  24.3 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  41.82 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  29.79 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  30.67 
 
 		 758 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  35.96 
 
 		 460 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>