149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5019 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  100 
 
 		 388 aa  762    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  83.76 
 
 		 385 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  67.35 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  61.22 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  59.64 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  60.46 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  60.46 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  60.46 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  60.46 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  60.46 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  60.46 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  60.46 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  58.82 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  58.82 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  58.06 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  56.01 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  60.56 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  56.31 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  54.2 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  53.85 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  52.93 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  55.13 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  53.59 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  53.85 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  53.18 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  52.93 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  52.15 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  53.18 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  52.39 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  51.65 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  57.14 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  54.91 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  54.62 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  54.2 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  58.87 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  58.87 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  57.4 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  57.91 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  54.73 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  58.61 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  57.91 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  53.92 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  52.19 
 
 		 387 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  52.19 
 
 		 387 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  51.93 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  52.63 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  55.14 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  50.63 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  50.63 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  50.63 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  49.62 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  42.68 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  40.75 
 
 		 365 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  39.83 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  42.7 
 
 		 361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  37.63 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  38.97 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  37.09 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  37.6 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  33.42 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.9 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.9 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.21 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  26.95 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  29.5 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.4 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.67 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.35 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.28 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.94 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  24.93 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25.74 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  23.36 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  31.52 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.87 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  32.76 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.93 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.31 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  29.82 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.06 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.72 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.72 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  25 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  25.06 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.86 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  27.41 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  61.4 
 
 		 84 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  33.09 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  42.03 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  27.44 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  25.74 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  28.03 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.02 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.27 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.25 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  34.41 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  24.67 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  35.96 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  35.71 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>