80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1514 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  100 
 
 
131 aa  257  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  95.42 
 
 
131 aa  247  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  44.09 
 
 
394 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  29.25 
 
 
412 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  27.88 
 
 
389 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  45.1 
 
 
422 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  51.06 
 
 
369 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  45.45 
 
 
417 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.37 
 
 
573 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  52.5 
 
 
380 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  42.86 
 
 
378 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  38.33 
 
 
680 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  46 
 
 
388 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  44.9 
 
 
453 aa  46.2  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  44.9 
 
 
460 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  38.46 
 
 
448 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.43 
 
 
615 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  35.56 
 
 
367 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  44.44 
 
 
382 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1546  hypothetical protein  41.82 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1549  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 
359 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.638976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  36.54 
 
 
448 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  48 
 
 
369 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.31 
 
 
409 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  36.21 
 
 
595 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  46.51 
 
 
419 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  42 
 
 
450 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  51.06 
 
 
419 aa  43.9  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  48.84 
 
 
653 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  40.91 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.22 
 
 
626 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  38 
 
 
393 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  32.94 
 
 
626 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  38 
 
 
410 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  53.49 
 
 
519 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  41.3 
 
 
390 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  42.22 
 
 
390 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  39.13 
 
 
418 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  43.48 
 
 
411 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  34.09 
 
 
663 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  31 
 
 
529 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  43.48 
 
 
426 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  42.22 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  43.9 
 
 
368 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  43.48 
 
 
513 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  42.22 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  43.48 
 
 
359 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  40 
 
 
395 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  40.43 
 
 
359 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  41.67 
 
 
641 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  34.52 
 
 
628 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.43 
 
 
369 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  39.13 
 
 
347 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.26 
 
 
640 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  43.9 
 
 
378 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  39.53 
 
 
388 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  36 
 
 
390 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  34.88 
 
 
397 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  40 
 
 
416 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  39.53 
 
 
388 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  45.45 
 
 
580 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  36.17 
 
 
407 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  40 
 
 
388 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  44.68 
 
 
368 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  32.08 
 
 
385 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  35.71 
 
 
514 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  45.65 
 
 
454 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  36.54 
 
 
648 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.51 
 
 
372 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  42 
 
 
437 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  38 
 
 
390 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  36 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  31.75 
 
 
387 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  38 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  38 
 
 
390 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  38 
 
 
390 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  32.26 
 
 
410 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  36.84 
 
 
994 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>