103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1497 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 573 aa  1161    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.49 
 
 		 578 aa  551  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.53 
 
 		 605 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.35 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  24.01 
 
 		 663 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.77 
 
 		 595 aa  91.7  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.47 
 
 		 603 aa  90.9  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.44 
 
 		 564 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.55 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.32 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  22.41 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.41 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.48 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.47 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.75 
 
 		 591 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.21 
 
 		 579 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.68 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.47 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.6 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.06 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  22.83 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  22.6 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.96 
 
 		 626 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.74 
 
 		 669 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  21.58 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.25 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  23.67 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  22.28 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.95 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.99 
 
 		 603 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  22.62 
 
 		 763 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  29.23 
 
 		 643 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  27.01 
 
 		 588 aa  54.3  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  24.86 
 
 		 368 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  22.76 
 
 		 744 aa  53.5  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  22.91 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.35 
 
 		 689 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  22.7 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.91 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.25 
 
 		 708 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  24.49 
 
 		 604 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  40.38 
 
 		 641 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  21.54 
 
 		 580 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  35.38 
 
 		 591 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.2 
 
 		 623 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.22 
 
 		 382 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  22.22 
 
 		 382 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  40.26 
 
 		 242 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  23.33 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  38.89 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  51.16 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  23.77 
 
 		 748 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  22.43 
 
 		 807 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  42 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  22.72 
 
 		 595 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 677 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.51 
 
 		 677 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  21.9 
 
 		 780 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  23.25 
 
 		 519 aa  47.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  29.36 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.83 
 
 		 613 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  39.62 
 
 		 782 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  45.61 
 
 		 513 aa  47  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  48.98 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  37.04 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  30 
 
 		 578 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  42.86 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  23.68 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  35.37 
 
 		 131 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.58 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  33.72 
 
 		 131 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.94 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  35.42 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.67 
 
 		 608 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  35.42 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  37.04 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  20.93 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  38.89 
 
 		 598 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  38.89 
 
 		 598 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  44.19 
 
 		 412 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2740  hypothetical protein  36.21 
 
 		 150 aa  45.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.95 
 
 		 634 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  48.89 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  39.58 
 
 		 391 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  45.65 
 
 		 258 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  39.58 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  35 
 
 		 226 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  31.82 
 
 		 515 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  32.29 
 
 		 264 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 793 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.12 
 
 		 553 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  52.5 
 
 		 565 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  34 
 
 		 604 aa  43.9  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  37.74 
 
 		 762 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  40 
 
 		 628 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  36.73 
 
 		 391 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  36.73 
 
 		 391 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.18 
 
 		 647 aa  43.9  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  22.38 
 
 		 572 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  38.1 
 
 		 556 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>