138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  767    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  96.64 
 
 
387 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  69.41 
 
 
392 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  68.1 
 
 
395 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  69.92 
 
 
436 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  69.92 
 
 
392 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  69.92 
 
 
436 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  69.92 
 
 
436 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  69.92 
 
 
392 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  69.92 
 
 
392 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  69.92 
 
 
436 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  64.77 
 
 
386 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  67.1 
 
 
386 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  67.1 
 
 
392 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  64.96 
 
 
390 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  66.24 
 
 
388 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  67.94 
 
 
393 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  68.3 
 
 
391 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  68.3 
 
 
391 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  68.3 
 
 
391 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  68.04 
 
 
391 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  67.78 
 
 
391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  67.78 
 
 
391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  59.59 
 
 
388 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  58.97 
 
 
390 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  59.23 
 
 
390 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  58.97 
 
 
390 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  58.72 
 
 
390 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  58.97 
 
 
390 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  56.89 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  57.14 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  58.35 
 
 
395 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  60.21 
 
 
386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  57.14 
 
 
393 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  58.25 
 
 
385 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  58.14 
 
 
387 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  56.93 
 
 
393 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  57.88 
 
 
387 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  57.36 
 
 
387 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  58.25 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  58.06 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  54.06 
 
 
388 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  53.57 
 
 
390 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  53.92 
 
 
390 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  53.92 
 
 
390 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  53.67 
 
 
390 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  51.65 
 
 
388 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  53.65 
 
 
392 aa  346  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  40.58 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  41.13 
 
 
367 aa  275  7e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  40.43 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  41.8 
 
 
361 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  40 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  37 
 
 
410 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  37.97 
 
 
385 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  39.74 
 
 
385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  34.04 
 
 
382 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.88 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  28.13 
 
 
382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.13 
 
 
382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.4 
 
 
382 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.49 
 
 
386 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.94 
 
 
397 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 
398 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  29.4 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  23.21 
 
 
370 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1049  hypothetical protein  63.41 
 
 
84 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  30.54 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  22.75 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  23.72 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25.55 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.24 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.09 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.24 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  28.64 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.18 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.81 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  27.38 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  20.55 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.4 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.25 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  22.38 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  22.38 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.07 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  21.08 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  41.56 
 
 
409 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.04 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.84 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  29.89 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  22.48 
 
 
430 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  34.44 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  25.85 
 
 
226 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  30.69 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.57 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  30.69 
 
 
370 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>