90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3711 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  100 
 
 		 653 aa  1363    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.33 
 
 		 663 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.74 
 
 		 681 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  29.03 
 
 		 626 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.15 
 
 		 626 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  28.97 
 
 		 648 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.91 
 
 		 607 aa  97.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.44 
 
 		 605 aa  95.1  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.96 
 
 		 603 aa  88.2  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.35 
 
 		 608 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  24.29 
 
 		 513 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.33 
 
 		 589 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  22.71 
 
 		 603 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  33.72 
 
 		 159 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.48 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.24 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.74 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.21 
 
 		 595 aa  67  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.44 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.17 
 
 		 579 aa  65.1  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  21.16 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.15 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.65 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.07 
 
 		 564 aa  60.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  20.95 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  27.53 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.64 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.35 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  21.93 
 
 		 623 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  35.29 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  20.04 
 
 		 598 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.5 
 
 		 608 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  25.64 
 
 		 604 aa  54.3  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.57 
 
 		 674 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  32.79 
 
 		 626 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.32 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.75 
 
 		 613 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.26 
 
 		 677 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.26 
 
 		 677 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.03 
 
 		 614 aa  51.6  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  22.71 
 
 		 769 aa  51.2  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.35 
 
 		 550 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  23.94 
 
 		 695 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  51.02 
 
 		 666 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  23.55 
 
 		 707 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.39 
 
 		 652 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  24.29 
 
 		 670 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  38.89 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.3 
 
 		 793 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.18 
 
 		 693 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  43.48 
 
 		 604 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.58 
 
 		 669 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.71 
 
 		 529 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 642 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.29 
 
 		 993 aa  48.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  34.67 
 
 		 424 aa  48.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  33.04 
 
 		 641 aa  47.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  29.67 
 
 		 276 aa  47.4  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  28.28 
 
 		 347 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  35.29 
 
 		 993 aa  47.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.03 
 
 		 546 aa  47.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  22.7 
 
 		 748 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.45 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.91 
 
 		 615 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.7 
 
 		 728 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  41.27 
 
 		 399 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  32.63 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  48.84 
 
 		 131 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  43.18 
 
 		 993 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  29.89 
 
 		 374 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  43.18 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  27.34 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  29.03 
 
 		 1162 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  38.89 
 
 		 519 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  34.07 
 
 		 369 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  53.33 
 
 		 1232 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.45 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  36.36 
 
 		 387 aa  44.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.01 
 
 		 584 aa  44.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.11 
 
 		 714 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  23.92 
 
 		 606 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 		 1181 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  33.7 
 
 		 582 aa  44.3  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  35.23 
 
 		 1146 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  41.79 
 
 		 669 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  48.84 
 
 		 131 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  36.76 
 
 		 657 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  45.45 
 
 		 1209 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.3 
 
 		 639 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>