90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4418 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  56.46 
 
 		 667 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  67.34 
 
 		 634 aa  901    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  52.46 
 
 		 645 aa  698    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 639 aa  1315    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  51.62 
 
 		 645 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  40.92 
 
 		 669 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  35.65 
 
 		 661 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  36.13 
 
 		 659 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  37.77 
 
 		 657 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  33.88 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  34.38 
 
 		 674 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  35.98 
 
 		 666 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.78 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.9 
 
 		 594 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.45 
 
 		 623 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.44 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.04 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.92 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.79 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.8 
 
 		 594 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.28 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  24.34 
 
 		 555 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  24.34 
 
 		 555 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.15 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  24.34 
 
 		 555 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.93 
 
 		 807 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  22.73 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  23.43 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.98 
 
 		 616 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.93 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.14 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.44 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.71 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  22.52 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.86 
 
 		 669 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  22.77 
 
 		 606 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  23.25 
 
 		 598 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.96 
 
 		 666 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.58 
 
 		 707 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.78 
 
 		 595 aa  54.7  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  23.21 
 
 		 554 aa  53.9  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  23.7 
 
 		 744 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.67 
 
 		 773 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.15 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.1 
 
 		 793 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  18.75 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25 
 
 		 762 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  22.33 
 
 		 703 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  23.25 
 
 		 598 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  28.19 
 
 		 600 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  23.23 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.44 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.28 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  24.39 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  28.11 
 
 		 773 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.01 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  24.35 
 
 		 628 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  23.49 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  21.99 
 
 		 769 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.76 
 
 		 529 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.79 
 
 		 652 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.29 
 
 		 540 aa  47.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25 
 
 		 691 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.31 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  23.68 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  31.31 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.54 
 
 		 578 aa  45.8  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  26.5 
 
 		 650 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  26.67 
 
 		 448 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  27.11 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  21.83 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  18.89 
 
 		 748 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.78 
 
 		 564 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  20.67 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.46 
 
 		 603 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.22 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.67 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.5 
 
 		 714 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  21.97 
 
 		 641 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.87 
 
 		 674 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.17 
 
 		 495 aa  44.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  38.1 
 
 		 610 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  22.01 
 
 		 758 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  22.52 
 
 		 339 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  22.87 
 
 		 340 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  24.84 
 
 		 522 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25.14 
 
 		 537 aa  43.9  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  40.3 
 
 		 653 aa  43.9  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>