72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2624 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1041    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  53.47 
 
 
513 aa  557  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.6 
 
 
616 aa  306  6e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.07 
 
 
608 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.39 
 
 
634 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  38.57 
 
 
628 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.34 
 
 
613 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  43.7 
 
 
276 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.33 
 
 
496 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.48 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.12 
 
 
626 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.06 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  23.73 
 
 
663 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  24.39 
 
 
681 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2740  hypothetical protein  38.52 
 
 
150 aa  66.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  21.7 
 
 
569 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  21.7 
 
 
569 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  22.79 
 
 
564 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.61 
 
 
604 aa  60.1  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  32.24 
 
 
159 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.14 
 
 
688 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  27.53 
 
 
653 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  26.09 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.7 
 
 
647 aa  55.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.24 
 
 
594 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.3 
 
 
650 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.52 
 
 
652 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  21.84 
 
 
603 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.95 
 
 
589 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  32.29 
 
 
529 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.57 
 
 
550 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.04 
 
 
608 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.09 
 
 
640 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0837  hypothetical protein  22.82 
 
 
644 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387147  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  34.09 
 
 
579 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  20.85 
 
 
758 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  34.21 
 
 
666 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  32.94 
 
 
574 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  38.75 
 
 
626 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.8 
 
 
615 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  27.32 
 
 
641 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  36.36 
 
 
623 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.16 
 
 
591 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30.28 
 
 
497 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.88 
 
 
780 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.55 
 
 
607 aa  47.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  29.25 
 
 
588 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  37.5 
 
 
586 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.95 
 
 
613 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  31 
 
 
669 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  23.61 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.94 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  30.1 
 
 
522 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  52.27 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.04 
 
 
573 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  24.21 
 
 
619 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.54 
 
 
580 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  46.81 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  25.26 
 
 
641 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.78 
 
 
669 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  25 
 
 
598 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.67 
 
 
578 aa  44.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30.17 
 
 
582 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  25 
 
 
598 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  29.33 
 
 
460 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  29.33 
 
 
460 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  37.5 
 
 
752 aa  43.9  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  34.62 
 
 
378 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  32.47 
 
 
378 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  33.77 
 
 
379 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  34.31 
 
 
691 aa  43.5  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  32.94 
 
 
564 aa  43.1  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>