130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1596 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
652 aa  1307    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  42.88 
 
 
666 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.19 
 
 
642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.11 
 
 
669 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.66 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
595 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.61 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.67 
 
 
603 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.97 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  28.74 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.88 
 
 
613 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.52 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.4 
 
 
598 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.05 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.88 
 
 
708 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.09 
 
 
688 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.84 
 
 
637 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.73 
 
 
584 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.94 
 
 
685 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.14 
 
 
564 aa  62.4  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.45 
 
 
548 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  20.73 
 
 
593 aa  60.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  23.62 
 
 
566 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  22.74 
 
 
594 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  26.43 
 
 
600 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  21.04 
 
 
604 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  27.46 
 
 
771 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  26.09 
 
 
586 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.94 
 
 
608 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.54 
 
 
634 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  22 
 
 
596 aa  57.8  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  21.98 
 
 
695 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  23.53 
 
 
596 aa  57.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.69 
 
 
663 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  23.1 
 
 
674 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.3 
 
 
579 aa  57.4  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.59 
 
 
607 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.65 
 
 
650 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  24.47 
 
 
581 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.28 
 
 
615 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.25 
 
 
616 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  20.47 
 
 
594 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  32.3 
 
 
619 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  35.51 
 
 
619 aa  56.6  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  28.82 
 
 
562 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  21.34 
 
 
645 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.92 
 
 
550 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.26 
 
 
591 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  27.06 
 
 
440 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26.24 
 
 
607 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  20.85 
 
 
558 aa  54.3  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.57 
 
 
613 aa  54.3  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  22.07 
 
 
583 aa  53.9  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  23.69 
 
 
588 aa  53.9  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  28.67 
 
 
508 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  21.85 
 
 
669 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  22.04 
 
 
580 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  26.52 
 
 
505 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  35.79 
 
 
582 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.73 
 
 
640 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.09 
 
 
605 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  22.66 
 
 
682 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.7 
 
 
564 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  20 
 
 
610 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.91 
 
 
573 aa  52.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 
574 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  29.77 
 
 
643 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.94 
 
 
608 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.26 
 
 
578 aa  52  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  26.52 
 
 
359 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  27.27 
 
 
513 aa  50.8  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  29.76 
 
 
658 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.19 
 
 
589 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.39 
 
 
653 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  29.9 
 
 
486 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  29.91 
 
 
606 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  21.19 
 
 
659 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.38 
 
 
582 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.29 
 
 
677 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 
437 aa  48.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  41.27 
 
 
681 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.79 
 
 
639 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  37.33 
 
 
697 aa  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.29 
 
 
677 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  38 
 
 
496 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  25.85 
 
 
401 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  28.03 
 
 
634 aa  47.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30.07 
 
 
497 aa  47.4  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  36.21 
 
 
398 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  23.3 
 
 
708 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.46 
 
 
422 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  37.5 
 
 
606 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 
1185 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  46.67 
 
 
397 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  42.55 
 
 
482 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  33.33 
 
 
577 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  24.19 
 
 
597 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  29.86 
 
 
537 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  27.66 
 
 
585 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.61 
 
 
648 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>