74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2759 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
608 aa  1225    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  50.99 
 
 
615 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  37.13 
 
 
606 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  39.22 
 
 
600 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  37.17 
 
 
586 aa  349  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  37.44 
 
 
619 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  36.03 
 
 
598 aa  335  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  35.45 
 
 
598 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  35.13 
 
 
641 aa  333  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  28.79 
 
 
604 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  25.59 
 
 
610 aa  97.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  29.61 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  24.76 
 
 
594 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.05 
 
 
695 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  25.06 
 
 
623 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.29 
 
 
603 aa  64.3  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.41 
 
 
607 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.09 
 
 
639 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  22.98 
 
 
596 aa  59.7  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.8 
 
 
605 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.62 
 
 
634 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25 
 
 
594 aa  57.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.21 
 
 
634 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.47 
 
 
579 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.58 
 
 
596 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.89 
 
 
653 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  32.18 
 
 
667 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  35.59 
 
 
661 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  24.26 
 
 
645 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  23.18 
 
 
604 aa  55.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  25.96 
 
 
603 aa  53.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  21 
 
 
550 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  21.85 
 
 
564 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  20.11 
 
 
650 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  34.95 
 
 
607 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  38.03 
 
 
666 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  23.18 
 
 
645 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.59 
 
 
688 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.94 
 
 
652 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.04 
 
 
685 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.35 
 
 
616 aa  51.6  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  27.66 
 
 
628 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  26.04 
 
 
505 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  28.73 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.46 
 
 
712 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.69 
 
 
598 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  25.71 
 
 
276 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.07 
 
 
594 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  25.68 
 
 
569 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  25.68 
 
 
569 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  25.83 
 
 
674 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  28.57 
 
 
565 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  29.55 
 
 
529 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  31.43 
 
 
379 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.76 
 
 
669 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.85 
 
 
681 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.43 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.04 
 
 
640 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.72 
 
 
647 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.43 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.37 
 
 
613 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  26.5 
 
 
626 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 
608 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 
642 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  32.46 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  35.29 
 
 
496 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  28.46 
 
 
554 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  23.42 
 
 
696 aa  44.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  26.04 
 
 
771 aa  44.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  34.88 
 
 
433 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.14 
 
 
613 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.17 
 
 
589 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  25.53 
 
 
513 aa  43.9  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>