39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0571 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 614 aa  1232    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  43.03 
 
 		 670 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  27.09 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  21.82 
 
 		 676 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.4 
 
 		 672 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  22.99 
 
 		 654 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  23.65 
 
 		 697 aa  94.7  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.83 
 
 		 681 aa  94.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  22.44 
 
 		 654 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  25.59 
 
 		 708 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  30.46 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.82 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  27.45 
 
 		 771 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.39 
 
 		 626 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  22.29 
 
 		 660 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  25.78 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  32.29 
 
 		 641 aa  57  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.88 
 
 		 613 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.03 
 
 		 653 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  48.89 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.36 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.87 
 
 		 582 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  27.2 
 
 		 437 aa  48.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.09 
 
 		 626 aa  47.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.84 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  32.93 
 
 		 258 aa  46.2  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  45.1 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  24.44 
 
 		 401 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  31.65 
 
 		 725 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  22.04 
 
 		 628 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  31.65 
 
 		 725 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  31.65 
 
 		 725 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  31.65 
 
 		 725 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  27.71 
 
 		 365 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.22 
 
 		 603 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07211  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 215 aa  43.9  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  31.65 
 
 		 725 aa  43.9  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  25.93 
 
 		 440 aa  43.9  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0003  recombination protein F  28.72 
 
 		 367 aa  43.9  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>