104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0378 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  100 
 
 
430 aa  886    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  36.32 
 
 
452 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.01 
 
 
482 aa  246  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  37.9 
 
 
423 aa  241  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  36.38 
 
 
422 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  34.72 
 
 
449 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.73 
 
 
437 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  32.63 
 
 
455 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  31.14 
 
 
422 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  32.99 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  29.93 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  32.65 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  31.59 
 
 
406 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  28.77 
 
 
410 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  44.24 
 
 
203 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.94 
 
 
440 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28.57 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  27.06 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.33 
 
 
454 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  28.08 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  29.43 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  25.44 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  26.55 
 
 
439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  48.11 
 
 
427 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  36.76 
 
 
420 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  42 
 
 
769 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  33.54 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  31.43 
 
 
577 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  42.72 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  32.7 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  39.8 
 
 
736 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  39.52 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  23.26 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  28.74 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  40.22 
 
 
709 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  30.43 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  33.33 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  24.74 
 
 
368 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  30.87 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  59.57 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  36.27 
 
 
619 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  35.96 
 
 
610 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  35.63 
 
 
452 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  40 
 
 
352 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  45.33 
 
 
79 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  31.2 
 
 
533 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  38.95 
 
 
353 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  28.47 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  26.18 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.78 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.67 
 
 
368 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  27.69 
 
 
461 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  38.16 
 
 
608 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  26.67 
 
 
588 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.13 
 
 
457 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  38.71 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  25.74 
 
 
530 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  33.64 
 
 
562 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  32.35 
 
 
584 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0479  ABC transporter ATP-binding protein  31.01 
 
 
336 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  27.07 
 
 
176 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  40.98 
 
 
670 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  30.97 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  26.9 
 
 
450 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  33.77 
 
 
336 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  38.16 
 
 
712 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  21.35 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  27.78 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  43.75 
 
 
877 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  26.75 
 
 
251 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  32.47 
 
 
447 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  40 
 
 
666 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 
416 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  25.23 
 
 
567 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  44 
 
 
647 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  26.05 
 
 
556 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.54 
 
 
607 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  25.68 
 
 
601 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.85 
 
 
708 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  27.47 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4015  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  33.33 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  42.86 
 
 
423 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  27.34 
 
 
399 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.31 
 
 
652 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  26.45 
 
 
653 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  28.46 
 
 
506 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  46.34 
 
 
926 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  20.47 
 
 
659 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  34.34 
 
 
591 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  44.07 
 
 
263 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  42 
 
 
513 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.38 
 
 
605 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  33.33 
 
 
529 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  30 
 
 
515 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  30.43 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  25.49 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  32.81 
 
 
276 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  32.98 
 
 
596 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  36.36 
 
 
452 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  35 
 
 
582 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>