63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4907 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1587    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  35.61 
 
 		 784 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  35.53 
 
 		 763 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  33.38 
 
 		 744 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  31.9 
 
 		 748 aa  353  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.49 
 
 		 780 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  28.66 
 
 		 807 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.83 
 
 		 773 aa  259  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.31 
 
 		 762 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.82 
 
 		 793 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  27.09 
 
 		 782 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.98 
 
 		 546 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.1 
 
 		 689 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.04 
 
 		 674 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  26.52 
 
 		 691 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.91 
 
 		 677 aa  159  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.91 
 
 		 677 aa  159  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.58 
 
 		 669 aa  157  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  22.8 
 
 		 714 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  24.87 
 
 		 773 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  23.2 
 
 		 696 aa  132  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  29.21 
 
 		 728 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  27.27 
 
 		 707 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.12 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  24.78 
 
 		 703 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.54 
 
 		 712 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  29.91 
 
 		 695 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  26.34 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  30.49 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.77 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  29.17 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  27.32 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.55 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.08 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.8 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 594 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.63 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  28.87 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  28.87 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.27 
 
 		 596 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.07 
 
 		 688 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.38 
 
 		 758 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.32 
 
 		 564 aa  55.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  26.29 
 
 		 682 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  21.88 
 
 		 659 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  23.6 
 
 		 661 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  22.71 
 
 		 653 aa  51.2  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.34 
 
 		 669 aa  51.2  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.92 
 
 		 669 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  29.76 
 
 		 663 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.41 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  23.35 
 
 		 634 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.99 
 
 		 639 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 645 aa  48.5  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.11 
 
 		 648 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.9 
 
 		 589 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26.42 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  26.98 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.05 
 
 		 647 aa  46.2  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  21.97 
 
 		 667 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  26.55 
 
 		 537 aa  45.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  41.51 
 
 		 680 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>