25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3314 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  54.05 
 
 		 654 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 654 aa  1355    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  33.55 
 
 		 591 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  29.05 
 
 		 676 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.51 
 
 		 672 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  25.67 
 
 		 708 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  29 
 
 		 494 aa  141  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.3 
 
 		 681 aa  132  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  23.72 
 
 		 697 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  27.86 
 
 		 670 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.44 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  31.49 
 
 		 771 aa  76.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  30.11 
 
 		 440 aa  51.6  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  24.47 
 
 		 588 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  24.61 
 
 		 668 aa  47.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  25.35 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.93 
 
 		 589 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.42 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.82 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  29.84 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  27.34 
 
 		 653 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  27.92 
 
 		 660 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.84 
 
 		 607 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.87 
 
 		 793 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  32.69 
 
 		 579 aa  44.3  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>