85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3655 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  51.24 
 
 		 780 aa  745    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  43.69 
 
 		 762 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  44.62 
 
 		 773 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 793 aa  1629    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  43.08 
 
 		 782 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  42.48 
 
 		 807 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  58.11 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  30.05 
 
 		 763 aa  343  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  34.97 
 
 		 748 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  31.69 
 
 		 744 aa  310  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  31.01 
 
 		 784 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.05 
 
 		 674 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  31.14 
 
 		 691 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  33 
 
 		 689 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  29.82 
 
 		 769 aa  250  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.62 
 
 		 669 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.54 
 
 		 677 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.54 
 
 		 677 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  29.93 
 
 		 728 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  30.73 
 
 		 707 aa  197  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  29.67 
 
 		 714 aa  195  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  28.27 
 
 		 696 aa  163  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  24.7 
 
 		 773 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  30.43 
 
 		 598 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  30.59 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.13 
 
 		 650 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.43 
 
 		 596 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  30.1 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  30 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.88 
 
 		 623 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  28.71 
 
 		 594 aa  77.4  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.68 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.58 
 
 		 637 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  21.06 
 
 		 669 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  28.16 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.98 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.23 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.73 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.43 
 
 		 688 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  25.59 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  26.55 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.93 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  28.5 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.72 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  29.55 
 
 		 565 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  25.36 
 
 		 674 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  22.31 
 
 		 682 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.33 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.91 
 
 		 594 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 640 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.5 
 
 		 669 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25 
 
 		 564 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  25.41 
 
 		 569 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  25.41 
 
 		 569 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.23 
 
 		 681 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.08 
 
 		 603 aa  52.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  28.42 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.1 
 
 		 639 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.64 
 
 		 564 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  26.02 
 
 		 645 aa  52  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.29 
 
 		 648 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.38 
 
 		 607 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.82 
 
 		 626 aa  51.2  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.49 
 
 		 634 aa  51.2  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.82 
 
 		 603 aa  50.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.23 
 
 		 663 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  29.14 
 
 		 537 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  22.78 
 
 		 667 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  22.49 
 
 		 416 aa  50.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  40.35 
 
 		 461 aa  49.3  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 		 582 aa  48.9  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.77 
 
 		 605 aa  48.5  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  25.76 
 
 		 653 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  25 
 
 		 520 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  19.44 
 
 		 666 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  40 
 
 		 451 aa  45.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  26.87 
 
 		 654 aa  44.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  42 
 
 		 595 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 573 aa  44.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.4 
 
 		 589 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  40.74 
 
 		 176 aa  44.3  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.65 
 
 		 607 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  26.67 
 
 		 736 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  25.63 
 
 		 628 aa  43.9  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>