190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1709 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  100 
 
 		 584 aa  1187    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.82 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.23 
 
 		 708 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.55 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.25 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  26.34 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.47 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  23.27 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  25.99 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.86 
 
 		 595 aa  72  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.76 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.17 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  28.57 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  23.49 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.67 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.67 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  23.26 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  27.95 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.66 
 
 		 393 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.73 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  24.32 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  30.59 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  23.49 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.6 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  21.5 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  21.68 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.25 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.24 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.58 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  23.42 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  23.39 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.16 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  29.24 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.94 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  25 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  33.73 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.7 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  29.73 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  22.09 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.84 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  26.44 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.82 
 
 		 382 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  23.08 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  23.08 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.22 
 
 		 395 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  22.24 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  27.27 
 
 		 571 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.97 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.58 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24 
 
 		 378 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  24.45 
 
 		 728 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  30.46 
 
 		 595 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.04 
 
 		 650 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  23.77 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  29.27 
 
 		 634 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.35 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.46 
 
 		 642 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  24.27 
 
 		 691 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  30.97 
 
 		 394 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  30.77 
 
 		 452 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.14 
 
 		 648 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  27.47 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 		 669 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  30 
 
 		 516 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.16 
 
 		 363 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.71 
 
 		 626 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.54 
 
 		 382 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  25.33 
 
 		 497 aa  50.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.54 
 
 		 382 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  24.14 
 
 		 508 aa  51.2  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  23.08 
 
 		 533 aa  50.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.69 
 
 		 429 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.23 
 
 		 663 aa  50.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.34 
 
 		 368 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  26.97 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  21.23 
 
 		 353 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  24.89 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  23.22 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  27.43 
 
 		 670 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  26.2 
 
 		 594 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22.36 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.48 
 
 		 674 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  28.68 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.24 
 
 		 685 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  22.31 
 
 		 386 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.05 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.12 
 
 		 589 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  19.91 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.53 
 
 		 603 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.55 
 
 		 399 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  34.72 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  25.12 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  22.25 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  20.82 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  24.09 
 
 		 573 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  22.79 
 
 		 392 aa  48.9  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26 
 
 		 607 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  29.63 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>