55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1861 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  32.91 
 
 
356 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  32.99 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  31.36 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  23.59 
 
 
345 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  27.6 
 
 
361 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  28.23 
 
 
350 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  37.16 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  27.03 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  27.3 
 
 
341 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  27.32 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  26.15 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  27.32 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  25.27 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  36.72 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  36.72 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  34.69 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  21.76 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  22.77 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  24.12 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  29.91 
 
 
140 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  31.85 
 
 
558 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  21.23 
 
 
584 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  37.5 
 
 
906 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  37.5 
 
 
906 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.5 
 
 
906 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  41.38 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  40.35 
 
 
906 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.85 
 
 
442 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  47.62 
 
 
533 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  40.35 
 
 
936 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  23.22 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2725  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.25 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  50 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  20.71 
 
 
478 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  42.22 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  40 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  50 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  51.11 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  34.85 
 
 
930 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  33.33 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  24.87 
 
 
410 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  40 
 
 
573 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  38.89 
 
 
623 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 
930 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  38.6 
 
 
942 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 
919 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  35.48 
 
 
928 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  34.21 
 
 
595 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  39.02 
 
 
744 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  27.47 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  40 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  29.76 
 
 
918 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>