34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1107 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  100 
 
 		 571 aa  1169    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  54.84 
 
 		 347 aa  379  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  37.13 
 
 		 573 aa  372  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  32.98 
 
 		 565 aa  330  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  39.41 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  30.16 
 
 		 580 aa  200  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  29.22 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  23.75 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  24.72 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  22.77 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  22.83 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  22.14 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0280  hypothetical protein  33.56 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  22.86 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.27 
 
 		 584 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  21.56 
 
 		 378 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  50 
 
 		 369 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  21.34 
 
 		 591 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  22.15 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  28.37 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  19.46 
 
 		 666 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.51 
 
 		 368 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.61 
 
 		 647 aa  47.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  48.84 
 
 		 359 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  51.16 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  51.22 
 
 		 380 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  30.1 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  28.95 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  54.55 
 
 		 762 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  24.07 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  34.92 
 
 		 528 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 702 aa  44.3  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  29.93 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  29.93 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>