118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4760 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1083    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  48.13 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  46.52 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  40.26 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  31.67 
 
 		 522 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  30.46 
 
 		 520 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  25.52 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  26.33 
 
 		 565 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  23.2 
 
 		 569 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  23.2 
 
 		 569 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  24.54 
 
 		 650 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.16 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  48.94 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  26.62 
 
 		 623 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  39.68 
 
 		 460 aa  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  38.1 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  23.52 
 
 		 758 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.08 
 
 		 584 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.74 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.7 
 
 		 773 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  44.83 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  45.45 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  42.11 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  22.85 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  52.38 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.25 
 
 		 784 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  46.81 
 
 		 359 aa  48.9  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.83 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  42.31 
 
 		 551 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  28.12 
 
 		 728 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  45.45 
 
 		 377 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.84 
 
 		 688 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  24.52 
 
 		 667 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  39.68 
 
 		 358 aa  47  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  40.74 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  27.84 
 
 		 598 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.45 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.91 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  27.59 
 
 		 1063 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25 
 
 		 691 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.85 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  47.62 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.89 
 
 		 353 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  24.04 
 
 		 763 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  43.64 
 
 		 551 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  46.94 
 
 		 555 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.55 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  26.55 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  46.81 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  41.3 
 
 		 935 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  34.38 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.73 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  46.81 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  23.25 
 
 		 634 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  50 
 
 		 350 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  38.64 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  45.24 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  34.62 
 
 		 513 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.64 
 
 		 373 aa  45.4  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  28.12 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  42.86 
 
 		 553 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  24.57 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  36.73 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  43.48 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.38 
 
 		 669 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.44 
 
 		 594 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  39.02 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.17 
 
 		 762 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  30.21 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  34.02 
 
 		 1232 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 581 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  40.82 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  42.55 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 362 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  38.3 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  40.74 
 
 		 553 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  43.48 
 
 		 789 aa  43.9  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  45.24 
 
 		 370 aa  43.9  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  31.4 
 
 		 659 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.48 
 
 		 429 aa  43.9  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  23.74 
 
 		 703 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 565 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.1 
 
 		 707 aa  43.9  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  40.74 
 
 		 554 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  40.48 
 
 		 364 aa  43.9  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>