122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0996 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 637 aa  1311    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  45.51 
 
 		 596 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  34.32 
 
 		 695 aa  293  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  33.22 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  26.25 
 
 		 623 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.38 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  23.6 
 
 		 758 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.68 
 
 		 553 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.11 
 
 		 613 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.84 
 
 		 703 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.45 
 
 		 594 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.45 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.06 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.31 
 
 		 594 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  33.83 
 
 		 596 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  27.46 
 
 		 712 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  30.28 
 
 		 807 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  22.48 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.45 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.58 
 
 		 793 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.91 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  30.56 
 
 		 763 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.71 
 
 		 762 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25 
 
 		 773 aa  71.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.93 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.44 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.44 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.31 
 
 		 728 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.13 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25 
 
 		 666 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.2 
 
 		 669 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.76 
 
 		 780 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.46 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  30 
 
 		 782 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.63 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.63 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  27.75 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  27.83 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  28.12 
 
 		 707 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  26.05 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.83 
 
 		 645 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.2 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  29.35 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.38 
 
 		 594 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  27.89 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.96 
 
 		 744 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  23.99 
 
 		 565 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  28.46 
 
 		 773 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.43 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  28.91 
 
 		 554 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  19.96 
 
 		 645 aa  54.3  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  34.29 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.67 
 
 		 659 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.92 
 
 		 708 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 495 aa  51.6  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  25 
 
 		 769 aa  50.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  28.95 
 
 		 537 aa  50.8  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  27.08 
 
 		 535 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  23.84 
 
 		 661 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  37.88 
 
 		 1190 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  37.04 
 
 		 1196 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  30.84 
 
 		 1115 aa  49.7  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.41 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.24 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.22 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  18.24 
 
 		 674 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  29.08 
 
 		 520 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  30.72 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.82 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  21.65 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1190 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  36.36 
 
 		 1191 aa  47.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  28.83 
 
 		 600 aa  47.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  29.11 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 556 aa  47  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.93 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  27.66 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  22.67 
 
 		 564 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.07 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  27.27 
 
 		 497 aa  46.6  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1234 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  21.07 
 
 		 667 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  34.85 
 
 		 1199 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.6 
 
 		 566 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1175 aa  45.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  32.1 
 
 		 1153 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  24.84 
 
 		 642 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  41.18 
 
 		 1168 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  34.85 
 
 		 1195 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1179 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  34.85 
 
 		 1195 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  34.85 
 
 		 1195 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 		 1181 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  31.82 
 
 		 1195 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.1 
 
 		 1176 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  32.35 
 
 		 1178 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  37.88 
 
 		 1163 aa  44.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  31 
 
 		 1280 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 		 1176 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>