79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0206 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
689 aa  1409    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  49.86 
 
 
691 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  80.6 
 
 
674 aa  1130    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.41 
 
 
669 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.39 
 
 
677 aa  303  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.39 
 
 
677 aa  303  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.66 
 
 
793 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.99 
 
 
762 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.82 
 
 
773 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.34 
 
 
782 aa  251  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.32 
 
 
728 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  32.16 
 
 
780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  28.24 
 
 
707 aa  243  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  27.56 
 
 
696 aa  239  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  32.67 
 
 
546 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  28.24 
 
 
714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  27.55 
 
 
748 aa  218  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  32.11 
 
 
807 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  27.79 
 
 
769 aa  205  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  28.1 
 
 
744 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  30.25 
 
 
763 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  27.69 
 
 
784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  25.17 
 
 
773 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  26.09 
 
 
613 aa  90.9  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30.52 
 
 
623 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.61 
 
 
569 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.61 
 
 
569 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.58 
 
 
695 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  25.18 
 
 
598 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.59 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.96 
 
 
594 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  32.76 
 
 
553 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  33.53 
 
 
758 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.51 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.27 
 
 
595 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.77 
 
 
596 aa  72  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  25.36 
 
 
650 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.44 
 
 
607 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.43 
 
 
615 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.24 
 
 
594 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  31.58 
 
 
712 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  28.37 
 
 
661 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  24.54 
 
 
596 aa  68.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.13 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.51 
 
 
659 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.9 
 
 
682 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28.14 
 
 
703 aa  63.9  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  22.49 
 
 
565 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.07 
 
 
669 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.17 
 
 
645 aa  56.6  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.68 
 
 
626 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.56 
 
 
578 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  30.82 
 
 
663 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.21 
 
 
603 aa  54.7  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.82 
 
 
564 aa  53.5  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.38 
 
 
688 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.35 
 
 
573 aa  52.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.86 
 
 
591 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.74 
 
 
454 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.8 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  23.08 
 
 
645 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.88 
 
 
589 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25.2 
 
 
574 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.82 
 
 
647 aa  48.5  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  29.15 
 
 
642 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.62 
 
 
634 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.13 
 
 
657 aa  47.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.94 
 
 
634 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  22.13 
 
 
626 aa  47.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.98 
 
 
399 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.27 
 
 
582 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.32 
 
 
669 aa  45.8  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  24.88 
 
 
520 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  27.6 
 
 
666 aa  44.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  19.82 
 
 
537 aa  44.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  23.74 
 
 
513 aa  44.3  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.1 
 
 
584 aa  44.3  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  30.5 
 
 
532 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  42.59 
 
 
382 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>