177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3144 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  100 
 
 		 682 aa  1411    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  39.44 
 
 		 695 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  33.09 
 
 		 596 aa  271  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.22 
 
 		 637 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  27.92 
 
 		 623 aa  204  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.78 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  26.8 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.46 
 
 		 703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.54 
 
 		 594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.58 
 
 		 615 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  34.72 
 
 		 650 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.27 
 
 		 669 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.98 
 
 		 598 aa  119  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.41 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.67 
 
 		 596 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  28.14 
 
 		 594 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  25.78 
 
 		 685 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  29.86 
 
 		 707 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.07 
 
 		 780 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.05 
 
 		 762 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  29.72 
 
 		 807 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.26 
 
 		 669 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  29.83 
 
 		 712 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.44 
 
 		 773 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.46 
 
 		 674 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  21.23 
 
 		 773 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  26.52 
 
 		 748 aa  80.5  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.05 
 
 		 782 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.87 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.75 
 
 		 574 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  26.04 
 
 		 728 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  29.3 
 
 		 696 aa  77.8  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  28.41 
 
 		 659 aa  77.8  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  24.21 
 
 		 667 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  28.16 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.28 
 
 		 546 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  28.43 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.24 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.51 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  30 
 
 		 691 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.77 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.73 
 
 		 689 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.64 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  32.48 
 
 		 688 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.77 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.77 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  31.18 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.14 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  30.41 
 
 		 661 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.94 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  27.23 
 
 		 769 aa  65.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.48 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26.8 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  27.62 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.82 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.06 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  28.24 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.86 
 
 		 589 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  48.39 
 
 		 1191 aa  61.6  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  27.68 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  31.75 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  28.44 
 
 		 555 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  28.44 
 
 		 555 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  28.44 
 
 		 555 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  29.17 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.59 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.34 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.04 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  23.65 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.46 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  26.67 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  27.12 
 
 		 553 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  26.63 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  27.17 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.34 
 
 		 584 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 645 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  28.17 
 
 		 543 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.49 
 
 		 569 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  27.39 
 
 		 544 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.49 
 
 		 569 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  28.78 
 
 		 554 aa  55.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  27.33 
 
 		 552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  27.33 
 
 		 552 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  27.33 
 
 		 552 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  27.33 
 
 		 552 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 552 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.75 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  29.91 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  22.6 
 
 		 544 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  25.64 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>