71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2370 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  67.09 
 
 		 552 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  65.46 
 
 		 552 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  67.63 
 
 		 555 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  66.73 
 
 		 552 aa  713    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  66.73 
 
 		 552 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  66.79 
 
 		 554 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  67.63 
 
 		 555 aa  752    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  67.63 
 
 		 555 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  66.73 
 
 		 552 aa  713    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  66.73 
 
 		 552 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  66.73 
 
 		 552 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  66.73 
 
 		 552 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  67.09 
 
 		 552 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  66.91 
 
 		 552 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  66.91 
 
 		 552 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  66.91 
 
 		 552 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  66.55 
 
 		 552 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  88.43 
 
 		 553 aa  985    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  66.73 
 
 		 552 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1129    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  80.51 
 
 		 554 aa  895    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  81.59 
 
 		 554 aa  913    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  66.73 
 
 		 552 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  43.45 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  44.73 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  43.78 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  44.46 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  37.65 
 
 		 558 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.49 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.79 
 
 		 607 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  25.35 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.29 
 
 		 647 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.08 
 
 		 688 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.31 
 
 		 574 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.15 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.37 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  22 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.12 
 
 		 682 aa  57  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  31.82 
 
 		 610 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  23.31 
 
 		 600 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.53 
 
 		 564 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  29.82 
 
 		 606 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.74 
 
 		 582 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.97 
 
 		 639 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.81 
 
 		 703 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.95 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  34.38 
 
 		 228 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.76 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  23.25 
 
 		 667 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  29.58 
 
 		 422 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  28.09 
 
 		 604 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.97 
 
 		 640 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  38.71 
 
 		 641 aa  47.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  32.26 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  24.55 
 
 		 613 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  24.19 
 
 		 758 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  39.13 
 
 		 598 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.55 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  39.13 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  48.21 
 
 		 267 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.66 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.14 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  36.36 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.95 
 
 		 608 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 		 626 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  39.66 
 
 		 619 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.93 
 
 		 707 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.32 
 
 		 712 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 		 346 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>