212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1874 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1441    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  46.59 
 
 		 712 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.63 
 
 		 613 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.72 
 
 		 594 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.89 
 
 		 598 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.76 
 
 		 594 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  26.44 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  25.78 
 
 		 623 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.46 
 
 		 682 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.7 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.29 
 
 		 615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.8 
 
 		 637 aa  107  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  32.47 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.73 
 
 		 758 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.37 
 
 		 596 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.05 
 
 		 695 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  31.01 
 
 		 607 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.4 
 
 		 793 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.8 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.72 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.07 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.78 
 
 		 769 aa  77  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  26.34 
 
 		 763 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.11 
 
 		 669 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  33.58 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  30.16 
 
 		 782 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  24.78 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  27.57 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  23.86 
 
 		 696 aa  70.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.67 
 
 		 762 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.78 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  32.09 
 
 		 707 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  28.85 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.56 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.91 
 
 		 691 aa  65.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  27.02 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.14 
 
 		 689 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  25.25 
 
 		 685 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  28.57 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.55 
 
 		 564 aa  62  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.22 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.35 
 
 		 674 aa  61.6  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  34.29 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.84 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  27.93 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  29.1 
 
 		 520 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  28 
 
 		 565 aa  55.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.99 
 
 		 603 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.92 
 
 		 666 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.49 
 
 		 669 aa  55.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  30.68 
 
 		 1209 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  29.23 
 
 		 543 aa  54.7  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.54 
 
 		 589 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 645 aa  54.3  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  34.21 
 
 		 537 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  26.48 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  20.85 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.97 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.13 
 
 		 615 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  20.28 
 
 		 598 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  28.77 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.33 
 
 		 639 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  27.17 
 
 		 574 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  26.45 
 
 		 553 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  24.39 
 
 		 535 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  25.16 
 
 		 554 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.18 
 
 		 634 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  33.87 
 
 		 1115 aa  51.2  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  28.26 
 
 		 544 aa  51.2  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  45.76 
 
 		 363 aa  50.8  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  25.81 
 
 		 555 aa  50.8  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  25.81 
 
 		 555 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  25.81 
 
 		 555 aa  50.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.5 
 
 		 552 aa  50.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  44.44 
 
 		 1199 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  40.74 
 
 		 478 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.75 
 
 		 607 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.46 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  21.84 
 
 		 641 aa  50.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  30.34 
 
 		 1232 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  25.52 
 
 		 667 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  25.81 
 
 		 553 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  26.11 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  26.11 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.63 
 
 		 605 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  26.11 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.35 
 
 		 657 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  35.71 
 
 		 994 aa  50.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  26.11 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  25.48 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  45.45 
 
 		 1191 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>