56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4162 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  54.47 
 
 		 586 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  100 
 
 		 600 aa  1227    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  48.32 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  48.08 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  47.91 
 
 		 641 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  49.5 
 
 		 619 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.31 
 
 		 615 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  39.13 
 
 		 606 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.39 
 
 		 608 aa  342  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  28.05 
 
 		 604 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  26.7 
 
 		 610 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.85 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.08 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  37.12 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  24.17 
 
 		 667 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.43 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.62 
 
 		 623 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.09 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  21.62 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.46 
 
 		 674 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.39 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  20.48 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  21.96 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  30.61 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.68 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.01 
 
 		 640 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.03 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.74 
 
 		 574 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.13 
 
 		 605 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 645 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  23.46 
 
 		 582 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  22.53 
 
 		 579 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  25.16 
 
 		 495 aa  53.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  23.65 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.77 
 
 		 685 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23 
 
 		 603 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  22.62 
 
 		 439 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.07 
 
 		 603 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.19 
 
 		 639 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  29.05 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  35 
 
 		 758 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  29.53 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.25 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.83 
 
 		 637 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  27.81 
 
 		 588 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.52 
 
 		 703 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  26.18 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.97 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.81 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.71 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.25 
 
 		 647 aa  44.3  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.81 
 
 		 594 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  39.39 
 
 		 688 aa  44.3  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  39.34 
 
 		 613 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>