84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003289 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  100 
 
 		 714 aa  1452    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  47.81 
 
 		 728 aa  631  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  48.92 
 
 		 707 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  37.23 
 
 		 696 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.82 
 
 		 669 aa  247  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  28.53 
 
 		 691 aa  233  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.49 
 
 		 677 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.4 
 
 		 674 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.49 
 
 		 677 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.65 
 
 		 689 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.49 
 
 		 793 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.67 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  25.25 
 
 		 782 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.44 
 
 		 773 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  26.2 
 
 		 744 aa  188  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.66 
 
 		 762 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  25.69 
 
 		 763 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  25.61 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.42 
 
 		 748 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  30.68 
 
 		 807 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  28.28 
 
 		 784 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  22.8 
 
 		 769 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  27.18 
 
 		 773 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.36 
 
 		 598 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.89 
 
 		 695 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.91 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.16 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.9 
 
 		 758 aa  77.8  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.31 
 
 		 626 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  30.35 
 
 		 594 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.2 
 
 		 594 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  26.49 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  32.58 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  25 
 
 		 596 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.9 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.18 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25 
 
 		 594 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.2 
 
 		 712 aa  67.4  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.52 
 
 		 647 aa  67  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  21.43 
 
 		 626 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  21.83 
 
 		 661 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.92 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  20.18 
 
 		 667 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  31.03 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.97 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.85 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.97 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.89 
 
 		 637 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.6 
 
 		 688 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  29.1 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.28 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.46 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.26 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.77 
 
 		 564 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.53 
 
 		 569 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.53 
 
 		 569 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  21.76 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.62 
 
 		 589 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  24.67 
 
 		 659 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.86 
 
 		 607 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.57 
 
 		 634 aa  51.2  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  21.76 
 
 		 565 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.12 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  54.55 
 
 		 641 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.03 
 
 		 708 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  24.48 
 
 		 642 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.44 
 
 		 663 aa  48.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  20.63 
 
 		 648 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  21.25 
 
 		 666 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.21 
 
 		 582 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  20.1 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  50 
 
 		 619 aa  45.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  25.49 
 
 		 522 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 666 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  41.54 
 
 		 544 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  23.67 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.5 
 
 		 639 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  18.18 
 
 		 645 aa  45.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.61 
 
 		 564 aa  44.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  19.8 
 
 		 600 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  20.63 
 
 		 634 aa  44.3  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.03 
 
 		 566 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  29.92 
 
 		 513 aa  44.3  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.04 
 
 		 603 aa  44.3  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>