63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0449 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  60.81 
 
 		 544 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1148    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  58.97 
 
 		 544 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  60.33 
 
 		 543 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  42.6 
 
 		 554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  42.99 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  42.99 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  42.99 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.5 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  43.78 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  43.22 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  43.22 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  43.22 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  43.22 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  43.04 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  43.27 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  42.6 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  41.88 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  40.97 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  38.53 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.55 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.84 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25.32 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  27.75 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  28.64 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 		 598 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.35 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.1 
 
 		 594 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.51 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.99 
 
 		 640 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  28.16 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  27.93 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.5 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.86 
 
 		 712 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.62 
 
 		 623 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.91 
 
 		 637 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.94 
 
 		 652 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.28 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  38.03 
 
 		 626 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  30.6 
 
 		 628 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.34 
 
 		 682 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  28.4 
 
 		 594 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  25.85 
 
 		 758 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.77 
 
 		 642 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.89 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  28.89 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  35.8 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  34.44 
 
 		 663 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  31.51 
 
 		 565 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  22.8 
 
 		 641 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  35.11 
 
 		 626 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  50 
 
 		 382 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  42.55 
 
 		 439 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  27.6 
 
 		 596 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  42.55 
 
 		 994 aa  43.9  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>