82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3185 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  100 
 
 		 641 aa  1315    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  67.09 
 
 		 619 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  64.25 
 
 		 598 aa  819    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  63.29 
 
 		 598 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  47.76 
 
 		 600 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  43.57 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.2 
 
 		 615 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  36.6 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.13 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  26.01 
 
 		 604 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  27.05 
 
 		 610 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.88 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.09 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.31 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.22 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.4 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.14 
 
 		 594 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.55 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.58 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  27.59 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  21.95 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  20.71 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.91 
 
 		 626 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  57.45 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 634 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.06 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.81 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.43 
 
 		 666 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.21 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  21.31 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  31.87 
 
 		 276 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.34 
 
 		 645 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  24.31 
 
 		 603 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.3 
 
 		 590 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  23.71 
 
 		 674 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  27.74 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.38 
 
 		 573 aa  51.6  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3334  hypothetical protein  26.7 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  45.61 
 
 		 565 aa  50.8  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.05 
 
 		 707 aa  50.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.32 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.82 
 
 		 550 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  21.84 
 
 		 703 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30.61 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.5 
 
 		 591 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  35.94 
 
 		 529 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  54.55 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.68 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  38.81 
 
 		 688 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  45.83 
 
 		 613 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.85 
 
 		 578 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  22.58 
 
 		 574 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.5 
 
 		 681 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  29.66 
 
 		 369 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  19.68 
 
 		 667 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  27.16 
 
 		 569 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  27.16 
 
 		 569 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  31.03 
 
 		 628 aa  47.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  41.67 
 
 		 349 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  33.82 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.67 
 
 		 672 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.08 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 543 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.82 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.92 
 
 		 652 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  36 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  48.94 
 
 		 391 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  38.46 
 
 		 784 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.32 
 
 		 594 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.86 
 
 		 596 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  25.26 
 
 		 505 aa  45.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  47.92 
 
 		 382 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.97 
 
 		 639 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  47.92 
 
 		 382 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  22.8 
 
 		 554 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.26 
 
 		 623 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  38.81 
 
 		 584 aa  44.3  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  41.67 
 
 		 439 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  44.19 
 
 		 744 aa  43.9  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  27.27 
 
 		 581 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>