141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3272 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  100 
 
 		 758 aa  1532    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  31.56 
 
 		 650 aa  345  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  26.07 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  33.71 
 
 		 553 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.57 
 
 		 615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.27 
 
 		 682 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  33.17 
 
 		 594 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  33.83 
 
 		 598 aa  124  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  23.69 
 
 		 712 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  38.19 
 
 		 695 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.71 
 
 		 596 aa  118  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  33.66 
 
 		 613 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.35 
 
 		 637 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  32.85 
 
 		 594 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28.73 
 
 		 703 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.8 
 
 		 669 aa  97.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.82 
 
 		 773 aa  93.6  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  28.9 
 
 		 596 aa  89.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  34.07 
 
 		 807 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.73 
 
 		 793 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.2 
 
 		 607 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.18 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.18 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.76 
 
 		 669 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  29.63 
 
 		 696 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 		 574 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.39 
 
 		 780 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  28.9 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.92 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.25 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.53 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.53 
 
 		 689 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.9 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 691 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 645 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  28.49 
 
 		 707 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.7 
 
 		 677 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.38 
 
 		 728 aa  72  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.7 
 
 		 677 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.87 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.58 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  28.63 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.3 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  29.49 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.14 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.32 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  25.09 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  25.09 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  25.09 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.45 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  23.52 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28 
 
 		 688 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  24.64 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  23.37 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  25.58 
 
 		 769 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  25.33 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.13 
 
 		 603 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  25.13 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  28.16 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25.35 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  26.67 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  27.23 
 
 		 784 aa  57  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.61 
 
 		 666 aa  57.4  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  25.71 
 
 		 659 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.3 
 
 		 607 aa  57.4  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  26.06 
 
 		 552 aa  57.4  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  25.45 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  25.45 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  25.45 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  25.45 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  25.45 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  28.28 
 
 		 497 aa  56.6  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.91 
 
 		 595 aa  55.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  27.13 
 
 		 685 aa  55.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  37.89 
 
 		 1184 aa  55.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 645 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.25 
 
 		 552 aa  54.7  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  27.27 
 
 		 543 aa  54.7  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.66 
 
 		 613 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  26.19 
 
 		 554 aa  53.9  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  23.64 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  35.29 
 
 		 669 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  17.36 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  23.64 
 
 		 553 aa  53.5  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  24.24 
 
 		 554 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  24.85 
 
 		 554 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  26.67 
 
 		 544 aa  52.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  28.82 
 
 		 661 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  28.47 
 
 		 606 aa  52  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.67 
 
 		 584 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>