60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2720 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  90.04 
 
 
552 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  64.44 
 
 
555 aa  703    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1126    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  99.82 
 
 
552 aa  1123    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  65.52 
 
 
554 aa  719    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  64.44 
 
 
555 aa  703    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  84.42 
 
 
552 aa  950    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  64.44 
 
 
555 aa  703    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 
552 aa  1126    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  99.82 
 
 
552 aa  1123    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  99.64 
 
 
552 aa  1122    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  90.04 
 
 
552 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  89.86 
 
 
552 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  90.04 
 
 
552 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  89.86 
 
 
552 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  99.46 
 
 
552 aa  1120    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  65.46 
 
 
553 aa  708    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1126    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  66.73 
 
 
553 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  67.69 
 
 
554 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  67.69 
 
 
554 aa  731    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  100 
 
 
552 aa  1126    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1126    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  41.7 
 
 
544 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  42.6 
 
 
554 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  43.82 
 
 
543 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  43.42 
 
 
544 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  38.1 
 
 
558 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.18 
 
 
566 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.62 
 
 
607 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.13 
 
 
647 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.27 
 
 
594 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.87 
 
 
574 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  24.75 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.15 
 
 
594 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.61 
 
 
598 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.41 
 
 
640 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.26 
 
 
596 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  31.34 
 
 
712 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  26.02 
 
 
594 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.48 
 
 
695 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.16 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.26 
 
 
564 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.48 
 
 
703 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.56 
 
 
553 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  26.06 
 
 
758 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  22.62 
 
 
650 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  20.72 
 
 
685 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  32.63 
 
 
346 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  46.67 
 
 
619 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  44.9 
 
 
641 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.77 
 
 
688 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.31 
 
 
682 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  20.45 
 
 
645 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.73 
 
 
601 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  48 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 
349 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  24.88 
 
 
519 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.88 
 
 
707 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  35.29 
 
 
659 aa  43.9  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>