121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1621 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1226    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.51 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  34.97 
 
 		 695 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  32.66 
 
 		 682 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30.48 
 
 		 623 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  24.95 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  26.34 
 
 		 613 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  32.76 
 
 		 650 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.59 
 
 		 615 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.15 
 
 		 594 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.11 
 
 		 598 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  25.15 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.4 
 
 		 596 aa  97.1  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.37 
 
 		 703 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  31.41 
 
 		 712 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  29.36 
 
 		 758 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.22 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  27.62 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.49 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.89 
 
 		 674 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.49 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  31.58 
 
 		 763 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.48 
 
 		 728 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  29.15 
 
 		 807 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  27.15 
 
 		 707 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  27 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.8 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.31 
 
 		 793 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.72 
 
 		 594 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.01 
 
 		 685 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  23.27 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  19.87 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  31.03 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.89 
 
 		 689 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  30.29 
 
 		 666 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  23.48 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.35 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.5 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.98 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  26.92 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  21.96 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.9 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.49 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.56 
 
 		 762 aa  57  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.95 
 
 		 780 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  26.27 
 
 		 769 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  23.2 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.05 
 
 		 569 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.05 
 
 		 569 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  23.55 
 
 		 422 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.81 
 
 		 642 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  29.11 
 
 		 782 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.1 
 
 		 748 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  21.32 
 
 		 634 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  20.45 
 
 		 659 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.5 
 
 		 595 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  25.58 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  26.6 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  22.05 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.57 
 
 		 708 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  34.33 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  22.19 
 
 		 427 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  44.07 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  23.27 
 
 		 744 aa  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.75 
 
 		 669 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  33.85 
 
 		 1179 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  37.8 
 
 		 440 aa  47.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  26.01 
 
 		 784 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  33.65 
 
 		 1163 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.34 
 
 		 529 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  31.43 
 
 		 607 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  25.31 
 
 		 535 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  32.93 
 
 		 1185 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  24.28 
 
 		 661 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1177 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  25.89 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1142 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.24 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1142 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  32.63 
 
 		 1144 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1142 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  26.55 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  34.72 
 
 		 688 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.56 
 
 		 369 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1145 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 		 1175 aa  46.2  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  35.38 
 
 		 1196 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  23.35 
 
 		 773 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  29.59 
 
 		 1082 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  26.98 
 
 		 628 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  32.98 
 
 		 1145 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  40.85 
 
 		 562 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  32.08 
 
 		 1195 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1146 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  32.98 
 
 		 1138 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  34.85 
 
 		 1178 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.82 
 
 		 584 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>