115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1049 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  100 
 
 		 537 aa  1085    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  27.08 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  25.78 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  28.6 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  24.87 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  25.52 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  25 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  30.85 
 
 		 565 aa  87  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.02 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  31.55 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  33.14 
 
 		 596 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  23.27 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.54 
 
 		 669 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  29.1 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.6 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.67 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  26.38 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.62 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  26.84 
 
 		 661 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  29.95 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  26.37 
 
 		 553 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  26.09 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  26.09 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  34.21 
 
 		 703 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  35.96 
 
 		 712 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  27.08 
 
 		 659 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  26.67 
 
 		 763 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  24.53 
 
 		 758 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  31.74 
 
 		 613 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  26.4 
 
 		 807 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.46 
 
 		 695 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.38 
 
 		 607 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1185 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.03 
 
 		 780 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.14 
 
 		 793 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 		 574 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.23 
 
 		 674 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.95 
 
 		 637 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  24.57 
 
 		 773 aa  50.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  27.54 
 
 		 748 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1177 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.35 
 
 		 762 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25.53 
 
 		 645 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  35 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  41.82 
 
 		 1141 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1150 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  25.15 
 
 		 685 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.37 
 
 		 677 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.37 
 
 		 677 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1179 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.27 
 
 		 688 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1178 aa  47.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1186 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1150 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.47 
 
 		 634 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.68 
 
 		 615 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  34.12 
 
 		 1205 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  42.31 
 
 		 1167 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.7 
 
 		 691 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  34.12 
 
 		 1199 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1138 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  32.32 
 
 		 1318 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1144 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  32.94 
 
 		 1217 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1194 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  34.12 
 
 		 1227 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  31.52 
 
 		 1225 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.86 
 
 		 652 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  32.94 
 
 		 1195 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  39.58 
 
 		 1174 aa  45.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  32.94 
 
 		 1195 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1163 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  26.55 
 
 		 769 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 1057 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  32.94 
 
 		 1195 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  43.75 
 
 		 1082 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.98 
 
 		 584 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  32.94 
 
 		 1183 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  39.62 
 
 		 1191 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.82 
 
 		 689 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1194 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  32.32 
 
 		 1280 aa  45.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1194 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2206  ABC transporter, ATP-binding protein  25.2 
 
 		 538 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  40 
 
 		 1145 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.62 
 
 		 376 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  32.65 
 
 		 1307 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1142 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1142 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1142 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.37 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1194 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.55 
 
 		 682 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1138 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1138 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  32.94 
 
 		 1181 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1138 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1138 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  31.76 
 
 		 1186 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.17 
 
 		 669 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>