65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1709 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  67.69 
 
 		 552 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  66.06 
 
 		 552 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  65.88 
 
 		 555 aa  750    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  67.69 
 
 		 552 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  67.69 
 
 		 552 aa  735    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  68.05 
 
 		 554 aa  774    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  65.88 
 
 		 555 aa  750    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  65.88 
 
 		 555 aa  750    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  67.69 
 
 		 552 aa  734    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  67.69 
 
 		 552 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  67.51 
 
 		 552 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  67.69 
 
 		 552 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  67.69 
 
 		 552 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  67.51 
 
 		 552 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  67.51 
 
 		 552 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  67.51 
 
 		 552 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  67.33 
 
 		 552 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  81.41 
 
 		 553 aa  907    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  67.69 
 
 		 552 aa  734    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  80.51 
 
 		 553 aa  918    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1132    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  96.03 
 
 		 554 aa  1049    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  67.69 
 
 		 552 aa  734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  41.56 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  42.03 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  42.65 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  42.47 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  39.25 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.92 
 
 		 566 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.65 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.94 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.25 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.23 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  20.68 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.88 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.01 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  20.72 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.32 
 
 		 623 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  32.22 
 
 		 610 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.1 
 
 		 682 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.88 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 582 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.94 
 
 		 639 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.11 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.66 
 
 		 695 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  21.71 
 
 		 574 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.15 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  21.8 
 
 		 600 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  34.94 
 
 		 758 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  21.69 
 
 		 667 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.69 
 
 		 712 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  23.87 
 
 		 703 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.68 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  22.56 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.48 
 
 		 637 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  19.89 
 
 		 650 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  21.09 
 
 		 604 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  43.75 
 
 		 641 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  20.88 
 
 		 606 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  37.1 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  45.83 
 
 		 598 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30.26 
 
 		 454 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  45.83 
 
 		 598 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 645 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.66 
 
 		 626 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>