157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0004 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  100 
 
 		 454 aa  939    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  35.73 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  33.06 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  33.61 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  31.83 
 
 		 422 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  30.67 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  27.73 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.11 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  30.23 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  31.06 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  28.2 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  27.84 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.12 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  31.2 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  27.33 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  28.13 
 
 		 482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.19 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  27.49 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  27.35 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  34.62 
 
 		 203 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  27.93 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  26.67 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  53.16 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  38.1 
 
 		 769 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  37.86 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.88 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  48.19 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  45.33 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  39.36 
 
 		 736 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  44.3 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  55.1 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  34.62 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  32.74 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  38.64 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  30.53 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  22.28 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  22.22 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  47.92 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  33.61 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  39.44 
 
 		 610 aa  53.9  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  28.95 
 
 		 176 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  35.29 
 
 		 712 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  20.09 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  27.85 
 
 		 532 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.74 
 
 		 689 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  29.7 
 
 		 582 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  33.71 
 
 		 619 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  48 
 
 		 657 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  44.9 
 
 		 339 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.12 
 
 		 409 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.26 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  31.17 
 
 		 608 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  30.6 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  30.11 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  44.44 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  42.11 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  27.51 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  45.45 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  44.64 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  46.94 
 
 		 669 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.09 
 
 		 674 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  31.91 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  28.57 
 
 		 588 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  45.65 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  46.81 
 
 		 1061 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  28.45 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  32.35 
 
 		 562 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  43.48 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  41.3 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  41.67 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1057 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  29 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  45.65 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  20.58 
 
 		 607 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  44.68 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  45.65 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  32.43 
 
 		 691 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  30 
 
 		 976 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  47.83 
 
 		 562 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.19 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 935 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  44.68 
 
 		 608 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.19 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  24.64 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  43.48 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  43.48 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  37.78 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  37.78 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  37.78 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  45.28 
 
 		 758 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  43.48 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  37.78 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  44.44 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>