143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1844 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 640 aa  1322    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  34.68 
 
 		 607 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.17 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.92 
 
 		 647 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  25.1 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  35.82 
 
 		 594 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  32.67 
 
 		 594 aa  98.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  32.04 
 
 		 613 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.69 
 
 		 596 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.62 
 
 		 650 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.95 
 
 		 674 aa  91.3  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.49 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  24.3 
 
 		 691 aa  84.7  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.15 
 
 		 669 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  23.19 
 
 		 659 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.38 
 
 		 688 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.93 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  30.07 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  22.63 
 
 		 696 aa  77.4  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.92 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.05 
 
 		 626 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.22 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.51 
 
 		 689 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  30.99 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  21.77 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25.38 
 
 		 728 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  23.9 
 
 		 714 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.33 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  26.34 
 
 		 553 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.2 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.73 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  23.14 
 
 		 565 aa  67  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  23.61 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  26.99 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.44 
 
 		 607 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.22 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.66 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  26.61 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  30.72 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  22.69 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  23.15 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.19 
 
 		 613 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  26.51 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.42 
 
 		 748 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  24.31 
 
 		 604 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  21.37 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  25.77 
 
 		 544 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  24.18 
 
 		 604 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.6 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  26.99 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.77 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.77 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  24.58 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.01 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.5 
 
 		 589 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  23.05 
 
 		 744 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.93 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.63 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  23.12 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.73 
 
 		 780 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  22.22 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  22.22 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  29.09 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  25.9 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  26.27 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.61 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  25 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  25 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24 
 
 		 564 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.01 
 
 		 807 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30.16 
 
 		 513 aa  56.2  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 793 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  22.15 
 
 		 600 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  28.84 
 
 		 663 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.01 
 
 		 648 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.11 
 
 		 784 aa  54.3  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  28.05 
 
 		 628 aa  54.3  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 645 aa  53.9  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  33 
 
 		 608 aa  53.9  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  24.73 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.85 
 
 		 661 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.73 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.84 
 
 		 674 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  23.47 
 
 		 598 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  32 
 
 		 634 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  35.29 
 
 		 708 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.11 
 
 		 773 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.77 
 
 		 615 aa  51.2  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>