59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0974 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1124    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  65.16 
 
 		 555 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  90.04 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  90.22 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  64.8 
 
 		 554 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  65.16 
 
 		 555 aa  708    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  65.16 
 
 		 555 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  90.04 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  90.22 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  90.04 
 
 		 552 aa  1000    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  100 
 
 		 552 aa  1124    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  90.04 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  99.82 
 
 		 552 aa  1120    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  99.82 
 
 		 552 aa  1120    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  99.64 
 
 		 552 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  89.86 
 
 		 552 aa  996    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  65.52 
 
 		 553 aa  695    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  90.04 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  67.09 
 
 		 553 aa  715    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  67.69 
 
 		 554 aa  726    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  66.97 
 
 		 554 aa  722    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  90.04 
 
 		 552 aa  1001    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  84.78 
 
 		 552 aa  946    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  43.32 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  40.83 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  42.73 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  42.81 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  38.1 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.65 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  26.27 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.23 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.2 
 
 		 594 aa  77  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  22.63 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.73 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.47 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.04 
 
 		 594 aa  60.1  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  25.25 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.12 
 
 		 688 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.73 
 
 		 640 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.94 
 
 		 582 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.82 
 
 		 695 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  29.32 
 
 		 712 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.33 
 
 		 594 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  27.22 
 
 		 553 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.56 
 
 		 650 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  26.11 
 
 		 703 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  25.45 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.29 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.37 
 
 		 707 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  35.37 
 
 		 346 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  28.42 
 
 		 349 aa  47.4  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  46.67 
 
 		 619 aa  47  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  44.9 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  26.36 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.05 
 
 		 601 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25 
 
 		 682 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  48.94 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  25.47 
 
 		 604 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  31.43 
 
 		 606 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>