65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0477 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1117    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  76.29 
 
 		 544 aa  872    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  60.33 
 
 		 554 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  73.53 
 
 		 544 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  44.77 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  44.77 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  44.77 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  43.92 
 
 		 554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  44.73 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.55 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  43.82 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  43.66 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  43.82 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  43.82 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  43.82 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.82 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  43.82 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  43.82 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  43.82 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  42.13 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  42.68 
 
 		 554 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  43.32 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  42.91 
 
 		 552 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  42.73 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  42.73 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  42.73 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  42.73 
 
 		 552 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  37.32 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.15 
 
 		 566 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.65 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.28 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  35.12 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.18 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.99 
 
 		 640 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.3 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.15 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.9 
 
 		 613 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  26.51 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  27.37 
 
 		 596 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  29.23 
 
 		 703 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  23.03 
 
 		 695 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.49 
 
 		 639 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  22.22 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  29.27 
 
 		 758 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  29.44 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  27.94 
 
 		 682 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.9 
 
 		 669 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.22 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  37.18 
 
 		 626 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  25.35 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  29.09 
 
 		 712 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  21.84 
 
 		 601 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  30.36 
 
 		 628 aa  47.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  47.06 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  44.9 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.63 
 
 		 564 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  42.86 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.48 
 
 		 605 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  34.43 
 
 		 604 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  44.9 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 685 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  31.76 
 
 		 603 aa  44.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.15 
 
 		 669 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  29.67 
 
 		 132 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  29.63 
 
 		 586 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>