59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0201 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  100 
 
 
558 aa  1153    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  39.01 
 
 
554 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  38.93 
 
 
554 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  37.25 
 
 
555 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  37.25 
 
 
555 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  37.25 
 
 
555 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  38.1 
 
 
552 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  38.1 
 
 
552 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  38.27 
 
 
552 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.1 
 
 
552 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  37.65 
 
 
553 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  38.04 
 
 
554 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  37.83 
 
 
553 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  38.45 
 
 
544 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  38.32 
 
 
544 aa  354  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.28 
 
 
552 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  38.53 
 
 
554 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  37.32 
 
 
543 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.7 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  24.1 
 
 
607 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.23 
 
 
647 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.72 
 
 
640 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  21.38 
 
 
598 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.6 
 
 
594 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.96 
 
 
594 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  29.21 
 
 
613 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.85 
 
 
596 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  20.9 
 
 
553 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  20.8 
 
 
574 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  29.49 
 
 
758 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.85 
 
 
652 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  29.93 
 
 
695 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.11 
 
 
594 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.97 
 
 
650 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.52 
 
 
582 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  35.11 
 
 
623 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  22.22 
 
 
703 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1679  ABC transporter related  33.8 
 
 
250 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.38 
 
 
564 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  33.33 
 
 
262 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  33.33 
 
 
261 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  33.08 
 
 
661 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  33.33 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.66 
 
 
637 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  28.85 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  30.88 
 
 
250 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  30.88 
 
 
250 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.57 
 
 
669 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  33.33 
 
 
626 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>