70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000190 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  100 
 
 		 544 aa  1126    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  87.13 
 
 		 544 aa  979    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  76.29 
 
 		 543 aa  838    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  60.81 
 
 		 554 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  44.3 
 
 		 555 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  44.3 
 
 		 555 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  44.3 
 
 		 555 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  43.5 
 
 		 554 aa  442  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  43.45 
 
 		 553 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.7 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  41.55 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  43.38 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  41.56 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  41.38 
 
 		 554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  41.7 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  40.83 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  40.83 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  40.83 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  40.83 
 
 		 552 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  40.83 
 
 		 552 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  38.45 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.14 
 
 		 566 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.75 
 
 		 607 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.95 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.94 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  24.48 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.14 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.51 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.43 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  23.57 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.1 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.42 
 
 		 623 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.46 
 
 		 669 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  29.71 
 
 		 596 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.78 
 
 		 594 aa  53.9  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  21.54 
 
 		 685 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  34.07 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  34.07 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28.26 
 
 		 703 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  34.83 
 
 		 382 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  40 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  21.96 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.93 
 
 		 758 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25 
 
 		 564 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.09 
 
 		 605 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  22.39 
 
 		 682 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  47.83 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.38 
 
 		 712 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  25.68 
 
 		 695 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  21.37 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  45.65 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  21.37 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  45.65 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.1 
 
 		 645 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  20.94 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  41.54 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  22.07 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  38.89 
 
 		 439 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  22.4 
 
 		 667 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.71 
 
 		 626 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.68 
 
 		 608 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  26.63 
 
 		 707 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>