95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0001 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  57.95 
 
 		 728 aa  778    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  100 
 
 		 707 aa  1424    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  49.26 
 
 		 714 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  40.87 
 
 		 696 aa  434  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.25 
 
 		 669 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.33 
 
 		 674 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.51 
 
 		 689 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  26.5 
 
 		 691 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.26 
 
 		 807 aa  230  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.39 
 
 		 677 aa  224  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.39 
 
 		 677 aa  224  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.94 
 
 		 780 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.64 
 
 		 793 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.29 
 
 		 773 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  25.35 
 
 		 782 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.45 
 
 		 762 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  29.3 
 
 		 763 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  24.27 
 
 		 784 aa  164  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  25.66 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  27.54 
 
 		 744 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  26.83 
 
 		 748 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  26.6 
 
 		 773 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  27.27 
 
 		 769 aa  120  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.27 
 
 		 598 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.9 
 
 		 695 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  31.08 
 
 		 553 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  29.8 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  28.91 
 
 		 682 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  26.58 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.19 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.28 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  26.79 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  22.01 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  28.49 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.37 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  27.07 
 
 		 685 aa  68.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  32.09 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.83 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  28.33 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  28.65 
 
 		 594 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.57 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.91 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  27.15 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.12 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.23 
 
 		 712 aa  64.3  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  25.22 
 
 		 659 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.27 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.65 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.44 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.74 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  26.44 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.03 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25 
 
 		 663 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  25.41 
 
 		 642 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  23.81 
 
 		 667 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.58 
 
 		 639 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  29.95 
 
 		 537 aa  55.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.21 
 
 		 634 aa  55.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.7 
 
 		 564 aa  54.7  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.48 
 
 		 615 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 645 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  26.99 
 
 		 603 aa  52.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.7 
 
 		 645 aa  51.6  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.12 
 
 		 681 aa  51.2  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  21.43 
 
 		 653 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  22.22 
 
 		 641 aa  51.2  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.22 
 
 		 657 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  21.62 
 
 		 648 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.87 
 
 		 552 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  26.72 
 
 		 628 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.44 
 
 		 566 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  21.19 
 
 		 619 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.03 
 
 		 647 aa  48.5  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.27 
 
 		 584 aa  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.22 
 
 		 626 aa  48.5  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  25.37 
 
 		 552 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  23.29 
 
 		 586 aa  47.4  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  25.37 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  25.37 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  25.37 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  25.37 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  24.61 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  24.61 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  24.61 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 		 574 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  25.9 
 
 		 565 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.82 
 
 		 564 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  23.81 
 
 		 554 aa  45.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  22.63 
 
 		 554 aa  45.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  22.93 
 
 		 553 aa  44.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  23.41 
 
 		 553 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  42.37 
 
 		 429 aa  44.3  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  25.13 
 
 		 544 aa  44.3  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  24.1 
 
 		 533 aa  43.9  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>