66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2720 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1595    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  47.55 
 
 		 763 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  43.15 
 
 		 744 aa  572  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  41.68 
 
 		 748 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  35.73 
 
 		 769 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  31.41 
 
 		 807 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  32.92 
 
 		 782 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  32.42 
 
 		 762 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.87 
 
 		 773 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  34 
 
 		 780 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.52 
 
 		 793 aa  316  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  33.16 
 
 		 546 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.43 
 
 		 669 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  30.12 
 
 		 691 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.49 
 
 		 674 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.41 
 
 		 677 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.41 
 
 		 677 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 689 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.37 
 
 		 707 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.22 
 
 		 714 aa  160  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.48 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.02 
 
 		 696 aa  150  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  22.43 
 
 		 773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.57 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30.65 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.7 
 
 		 712 aa  72  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  28.52 
 
 		 594 aa  72  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.26 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.34 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  29.48 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.78 
 
 		 594 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28.85 
 
 		 703 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.35 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  25.45 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  26.18 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  30.09 
 
 		 553 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  23.62 
 
 		 682 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  29.14 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.07 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.46 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  27.22 
 
 		 758 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 645 aa  55.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.11 
 
 		 640 aa  54.3  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  23.43 
 
 		 669 aa  54.3  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.93 
 
 		 594 aa  54.3  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  20.54 
 
 		 685 aa  51.6  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  22.83 
 
 		 657 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.39 
 
 		 639 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.73 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  26.77 
 
 		 642 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  25.25 
 
 		 533 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  26.01 
 
 		 596 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.45 
 
 		 669 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  22.82 
 
 		 667 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  25.57 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  25.57 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.85 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  24.29 
 
 		 565 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  25.41 
 
 		 666 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  25.95 
 
 		 564 aa  45.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  38.46 
 
 		 641 aa  45.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3334  hypothetical protein  25.35 
 
 		 302 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.26 
 
 		 566 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25 
 
 		 564 aa  44.3  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.6 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.45 
 
 		 363 aa  43.9  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>