111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1604 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1403    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  43.82 
 
 		 674 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  36.54 
 
 		 659 aa  416  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 645 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  33.48 
 
 		 645 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.88 
 
 		 639 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  31.08 
 
 		 667 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  32.73 
 
 		 634 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  30.55 
 
 		 661 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  34.17 
 
 		 669 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  33.58 
 
 		 657 aa  361  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  34.67 
 
 		 666 aa  349  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.85 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.1 
 
 		 623 aa  94.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.58 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  23.5 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.57 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.31 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.43 
 
 		 695 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.09 
 
 		 574 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.76 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.45 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.51 
 
 		 666 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  27.07 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.64 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  26.24 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  22.88 
 
 		 529 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.59 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.6 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.22 
 
 		 640 aa  65.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.29 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.22 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.41 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.74 
 
 		 688 aa  64.3  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  22.01 
 
 		 596 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  25.1 
 
 		 728 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.77 
 
 		 553 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.25 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.28 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.94 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  21.16 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.89 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20.56 
 
 		 681 aa  60.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.05 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  28.7 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  20.7 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.46 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  24.93 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  20.16 
 
 		 594 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  24.11 
 
 		 782 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.13 
 
 		 603 aa  55.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  27.87 
 
 		 564 aa  54.7  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  37.8 
 
 		 604 aa  54.3  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.75 
 
 		 762 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.8 
 
 		 637 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  21.58 
 
 		 619 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.79 
 
 		 615 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.3 
 
 		 647 aa  53.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  22.54 
 
 		 600 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  24.13 
 
 		 586 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.97 
 
 		 1178 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  23.58 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  21.5 
 
 		 763 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  20.54 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  24.34 
 
 		 598 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  21.54 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  22.73 
 
 		 544 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.87 
 
 		 595 aa  50.8  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.71 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.6 
 
 		 616 aa  50.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.2 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  32.88 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  36.05 
 
 		 1179 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  26.99 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  38.24 
 
 		 513 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.24 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  50 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  23.52 
 
 		 598 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.39 
 
 		 677 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.39 
 
 		 677 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  23.48 
 
 		 691 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  37.31 
 
 		 397 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  21.99 
 
 		 663 aa  47.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  21.83 
 
 		 606 aa  47.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.7 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  34.88 
 
 		 1178 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  34.88 
 
 		 1186 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  24.22 
 
 		 520 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  24.36 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  31.18 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  21.61 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1185 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  30.3 
 
 		 448 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  40.68 
 
 		 1185 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  19.32 
 
 		 450 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29 
 
 		 399 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  31.87 
 
 		 376 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>