92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4449 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  100 
 
 
564 aa  1159    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  31.77 
 
 
604 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.41 
 
 
579 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.2 
 
 
603 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.31 
 
 
582 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.17 
 
 
607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.53 
 
 
591 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.66 
 
 
605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.6 
 
 
595 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.77 
 
 
589 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.57 
 
 
648 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  27.32 
 
 
603 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.25 
 
 
626 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.05 
 
 
529 aa  96.7  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  23.16 
 
 
626 aa  90.9  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.44 
 
 
573 aa  87.8  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  21.36 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.74 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  20.99 
 
 
659 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.62 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  29.02 
 
 
688 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.24 
 
 
613 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.7 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.21 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  23.53 
 
 
594 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.94 
 
 
578 aa  62  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.33 
 
 
550 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  24.89 
 
 
685 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.83 
 
 
623 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  22.79 
 
 
505 aa  60.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  25.15 
 
 
661 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2782  hypothetical protein  26.03 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.94 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  20.95 
 
 
653 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.69 
 
 
669 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  21.93 
 
 
596 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.31 
 
 
634 aa  57.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  30.56 
 
 
807 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.95 
 
 
642 aa  57  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24 
 
 
640 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.1 
 
 
681 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.28 
 
 
616 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  33.62 
 
 
607 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  28.21 
 
 
773 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  27.42 
 
 
642 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1891  SMC domain protein  22.57 
 
 
628 aa  53.9  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.77 
 
 
594 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.22 
 
 
613 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.47 
 
 
677 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.47 
 
 
677 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.7 
 
 
652 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.13 
 
 
696 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.64 
 
 
793 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.84 
 
 
728 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  25.9 
 
 
645 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  33.33 
 
 
369 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.81 
 
 
628 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  22.57 
 
 
594 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25 
 
 
645 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  27.65 
 
 
773 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  31.58 
 
 
643 aa  50.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.86 
 
 
674 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.56 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.41 
 
 
650 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  21.49 
 
 
399 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.85 
 
 
689 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  32.46 
 
 
553 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  20.43 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  24.47 
 
 
546 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.43 
 
 
608 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.14 
 
 
780 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  32.97 
 
 
159 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  32.04 
 
 
409 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  26.38 
 
 
558 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  24.29 
 
 
606 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  26.19 
 
 
634 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.91 
 
 
566 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.82 
 
 
707 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  25.57 
 
 
782 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.78 
 
 
639 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  29.37 
 
 
703 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.9 
 
 
762 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.58 
 
 
674 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.07 
 
 
574 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  23.12 
 
 
695 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  29.67 
 
 
758 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.61 
 
 
714 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.15 
 
 
548 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  27.38 
 
 
259 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25 
 
 
784 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  18.93 
 
 
336 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  43.75 
 
 
431 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>