70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0597 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1571    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  26.43 
 
 		 728 aa  154  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.17 
 
 		 689 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.79 
 
 		 674 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.87 
 
 		 769 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  25.99 
 
 		 696 aa  134  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.92 
 
 		 669 aa  131  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  26.6 
 
 		 707 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  24.59 
 
 		 748 aa  127  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  23.42 
 
 		 762 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  27.18 
 
 		 714 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.55 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.38 
 
 		 780 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  21.1 
 
 		 744 aa  119  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  23.53 
 
 		 691 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  21.4 
 
 		 782 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  21.57 
 
 		 773 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.7 
 
 		 793 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.74 
 
 		 677 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.74 
 
 		 677 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  26.69 
 
 		 763 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  31.08 
 
 		 807 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  27.78 
 
 		 546 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  22.03 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  21.45 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  31 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  23.23 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.09 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  27.73 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.46 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  27.14 
 
 		 688 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.37 
 
 		 623 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  28.21 
 
 		 564 aa  55.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.83 
 
 		 598 aa  54.7  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.37 
 
 		 594 aa  54.3  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.18 
 
 		 594 aa  54.3  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25 
 
 		 607 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.14 
 
 		 594 aa  52.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  26.78 
 
 		 596 aa  50.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.12 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.9 
 
 		 550 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.74 
 
 		 708 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.52 
 
 		 669 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 640 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.11 
 
 		 639 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 615 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  26.11 
 
 		 565 aa  48.5  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 		 574 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  28.65 
 
 		 744 aa  47.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.75 
 
 		 589 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  23.32 
 
 		 667 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  23.35 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 874 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.68 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.96 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.22 
 
 		 595 aa  45.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  24.44 
 
 		 666 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 897 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 897 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 874 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 897 aa  45.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  28.18 
 
 		 569 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.78 
 
 		 548 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  28.18 
 
 		 569 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  25.13 
 
 		 659 aa  45.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  24.32 
 
 		 642 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  23.81 
 
 		 634 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.7 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 874 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>