60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3383 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1154    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1154    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  51.24 
 
 		 565 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  23.2 
 
 		 533 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  26.24 
 
 		 541 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  23.46 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.3 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  27.03 
 
 		 535 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  26.3 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.61 
 
 		 689 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  22.84 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  22.18 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.42 
 
 		 613 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.86 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  23.61 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  21.7 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  22.29 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.76 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.19 
 
 		 712 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  28.87 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.88 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.22 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  21.99 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.49 
 
 		 780 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  21.37 
 
 		 594 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  22.74 
 
 		 696 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  22.53 
 
 		 714 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  22.05 
 
 		 596 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  20.84 
 
 		 594 aa  55.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  26.09 
 
 		 537 aa  55.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  24.3 
 
 		 650 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  21.79 
 
 		 728 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.41 
 
 		 793 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.35 
 
 		 677 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.35 
 
 		 677 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  23.63 
 
 		 688 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  22.01 
 
 		 748 aa  50.4  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.29 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  23.02 
 
 		 513 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.63 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.68 
 
 		 608 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.14 
 
 		 594 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  26.52 
 
 		 807 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  27.16 
 
 		 641 aa  47.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  25.57 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  42.86 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.09 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  21.37 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  25.93 
 
 		 604 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  22.28 
 
 		 773 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  30 
 
 		 598 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  24.58 
 
 		 598 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  18.88 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  28.18 
 
 		 773 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  28.7 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  38.46 
 
 		 361 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  22.49 
 
 		 682 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  44.19 
 
 		 356 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.23 
 
 		 666 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 406 aa  43.5  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>