78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3946 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  724    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  54.26 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  46.32 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  43.67 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  35.25 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  30.15 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  27.64 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  25.81 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  25.67 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  25.67 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  26.86 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  25.87 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  26.25 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  26.25 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  25 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  25.98 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  29.27 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  29.51 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  22.89 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  30.86 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  46.97 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  48.94 
 
 		 533 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  20.82 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  23.15 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0002  DNA replication and repair protein RecF  34.25 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.25 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00329262  decreased coverage  0.000397503 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  30.59 
 
 		 758 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  41.67 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.78 
 
 		 647 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  42.11 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  45 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  45.16 
 
 		 520 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  22.34 
 
 		 378 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.9 
 
 		 420 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  33.33 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.18 
 
 		 608 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  25.61 
 
 		 650 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 		 495 aa  46.2  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28237  predicted protein  27.01 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  43.14 
 
 		 696 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  32 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  39.58 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2858  hypothetical protein  46.94 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  43.18 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3238  hypothetical protein  46.94 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  43.18 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.3 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.82 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180653  normal  0.423581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0003  recombination protein F  39.68 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  23.32 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0003  recombination protein F  39.68 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133569  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  22.43 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  23.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  34.85 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  46.67 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  42.55 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  28.35 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0003  recombination protein F  39.68 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0851424  hitchhiker  0.00000000117147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  35.85 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0003  recombination protein F  39.68 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0977543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  46.51 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  44.19 
 
 		 569 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  44.19 
 
 		 569 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  32.47 
 
 		 538 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  32.47 
 
 		 534 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  38.81 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  42 
 
 		 714 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  23.53 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  38.89 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  33.71 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  26.9 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  45.65 
 
 		 445 aa  43.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.83 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0596  DNA replication and repair protein RecF  39.13 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  39.66 
 
 		 454 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  21.05 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  37.78 
 
 		 581 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>