86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0630 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1035    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  53.47 
 
 		 505 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.84 
 
 		 616 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.07 
 
 		 608 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  41.59 
 
 		 628 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.97 
 
 		 634 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.42 
 
 		 613 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  41.89 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  24.29 
 
 		 653 aa  86.7  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.12 
 
 		 626 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  33.13 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  24.7 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2740  hypothetical protein  37.23 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.48 
 
 		 674 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  38.1 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  26.7 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  35.29 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.2 
 
 		 603 aa  57.4  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.16 
 
 		 640 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  21.29 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 566 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  30.63 
 
 		 619 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  20.09 
 
 		 681 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  21.46 
 
 		 398 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 652 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  21.7 
 
 		 654 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.35 
 
 		 647 aa  50.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  32.64 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  21.2 
 
 		 399 aa  50.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.83 
 
 		 615 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  30.61 
 
 		 641 aa  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  23.44 
 
 		 604 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  38.24 
 
 		 685 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  26.88 
 
 		 663 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.38 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  23.02 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  27.63 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  23.02 
 
 		 569 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  44.68 
 
 		 744 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.14 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  30.43 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  22.41 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.18 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  38.33 
 
 		 604 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  24.35 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  33.05 
 
 		 1181 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  25 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  30.19 
 
 		 588 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  30.56 
 
 		 514 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.09 
 
 		 669 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  23.2 
 
 		 703 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  31.25 
 
 		 773 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.61 
 
 		 573 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  28.12 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  28.42 
 
 		 598 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  27.74 
 
 		 807 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  35.09 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  33.85 
 
 		 572 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  31.37 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  45.65 
 
 		 131 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  35.21 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  30.12 
 
 		 758 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  29.55 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  22.27 
 
 		 688 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.46 
 
 		 1184 aa  45.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  50 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  27.37 
 
 		 598 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  51.16 
 
 		 353 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  27.83 
 
 		 1178 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  38.89 
 
 		 349 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  32.65 
 
 		 929 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  44.83 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  25.51 
 
 		 546 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  29.92 
 
 		 714 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.53 
 
 		 608 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  21.9 
 
 		 1192 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  39.13 
 
 		 682 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  42 
 
 		 430 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  29.52 
 
 		 596 aa  43.9  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 697 aa  43.9  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  45.83 
 
 		 519 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0837  hypothetical protein  48.98 
 
 		 644 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>