29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0196 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  54.05 
 
 		 654 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 654 aa  1348    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  33.7 
 
 		 591 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  26.9 
 
 		 676 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.11 
 
 		 672 aa  173  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  26.96 
 
 		 494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.59 
 
 		 681 aa  120  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  30.22 
 
 		 708 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  25.94 
 
 		 670 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  23.98 
 
 		 697 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.99 
 
 		 614 aa  94.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  32.2 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.28 
 
 		 666 aa  54.3  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  30 
 
 		 976 aa  53.9  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.41 
 
 		 582 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.33 
 
 		 628 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  21.7 
 
 		 513 aa  50.8  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  23.32 
 
 		 668 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  22.72 
 
 		 641 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  27.39 
 
 		 586 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  31.52 
 
 		 597 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.18 
 
 		 605 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.66 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.02 
 
 		 613 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.23 
 
 		 626 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  24.32 
 
 		 595 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.54 
 
 		 648 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  27.32 
 
 		 660 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  39.68 
 
 		 579 aa  43.9  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>