66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0111 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  24.64 
 
 
444 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  29.69 
 
 
976 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  32 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  23.56 
 
 
336 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.78 
 
 
455 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  45.31 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  34.78 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  33.7 
 
 
482 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  31.67 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  41.46 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  35.87 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  40.86 
 
 
451 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  31.75 
 
 
457 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  36.71 
 
 
251 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  40 
 
 
464 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  31.52 
 
 
452 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  37.23 
 
 
708 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  36.49 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  34.95 
 
 
421 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  35.42 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.81 
 
 
672 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  33.33 
 
 
446 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  31.37 
 
 
439 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  27.23 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.63 
 
 
681 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  31.33 
 
 
458 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  47.83 
 
 
464 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  43.75 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  31.51 
 
 
571 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  22.41 
 
 
513 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.93 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.18 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  40.28 
 
 
443 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  27.91 
 
 
203 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.52 
 
 
457 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  40.35 
 
 
427 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  36.49 
 
 
532 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  36 
 
 
410 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  37.5 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  38.81 
 
 
455 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  37.5 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  22.93 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  28.1 
 
 
697 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  34.29 
 
 
647 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  38.24 
 
 
676 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  28.45 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  43.14 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.37 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  39.39 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  36.71 
 
 
769 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  36.71 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  37.5 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  34.85 
 
 
176 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  32.2 
 
 
422 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  37.31 
 
 
670 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  25 
 
 
595 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  30.43 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  32.76 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  39.71 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  32.5 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  23.86 
 
 
533 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  39.06 
 
 
461 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  31.4 
 
 
654 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  37.29 
 
 
736 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  34.21 
 
 
478 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>