109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6911 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 669 aa  1379    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.41 
 
 		 689 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.42 
 
 		 674 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  34.52 
 
 		 691 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.14 
 
 		 677 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.14 
 
 		 677 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.98 
 
 		 780 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  30.1 
 
 		 807 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  30.53 
 
 		 762 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  29.63 
 
 		 773 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  27.18 
 
 		 728 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  32.09 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  27.11 
 
 		 707 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  30.65 
 
 		 782 aa  251  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  27.82 
 
 		 714 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.62 
 
 		 793 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  28.31 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  26.41 
 
 		 696 aa  227  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  28 
 
 		 748 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  26.86 
 
 		 763 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  27.71 
 
 		 744 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  24.58 
 
 		 769 aa  157  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  21.92 
 
 		 773 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30 
 
 		 695 aa  84  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  30.41 
 
 		 661 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.57 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.41 
 
 		 650 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.5 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28.11 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  31.36 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  27.75 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  30.24 
 
 		 553 aa  74.3  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  28.26 
 
 		 682 aa  73.9  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  33.33 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.91 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  31.88 
 
 		 594 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.14 
 
 		 669 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 645 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  28.5 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  25.23 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.36 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  29.78 
 
 		 596 aa  67  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  25.29 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  26.03 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  27.38 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.41 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  26.8 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  23.79 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.09 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  29.51 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.7 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  27.01 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  27.54 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.74 
 
 		 573 aa  60.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  26.16 
 
 		 634 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  31.5 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  26.88 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  26.88 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  25.11 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.69 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.82 
 
 		 574 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.93 
 
 		 708 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.57 
 
 		 605 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.86 
 
 		 639 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.08 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 626 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.77 
 
 		 669 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.05 
 
 		 674 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.88 
 
 		 666 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.47 
 
 		 603 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.57 
 
 		 540 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.37 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  29.46 
 
 		 513 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  24.7 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  28.26 
 
 		 648 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.55 
 
 		 594 aa  52  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 533 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  26.38 
 
 		 565 aa  52  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  25.23 
 
 		 520 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30 
 
 		 584 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.91 
 
 		 582 aa  51.2  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.24 
 
 		 437 aa  50.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  28.24 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.86 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  50.98 
 
 		 680 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  41.25 
 
 		 369 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  26.7 
 
 		 744 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 607 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  30.58 
 
 		 653 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  27.53 
 
 		 420 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  25.14 
 
 		 638 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  20.34 
 
 		 598 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  31 
 
 		 505 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.93 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  26.09 
 
 		 513 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  25.73 
 
 		 522 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  20.15 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  26.79 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.89 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>